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논문 기본정보

Genetic Diversity Analysis of Modern Japonica Rice from Taihu Area Based on Simple Sequence Repeat Markers

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 農業生物技術學報 = Journal of agricultural biotechnology
ISSN 1674-7968,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) LUO, Bing,XU, Gang-ming,SUN, Hai-yan,YANG, Zhi-gang,SHEN, Zong-gen,GAO, Yang,WANG, Xiao-hu,DUAN, Mu-yin-xi
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 타이후호(Taihu Lake) 지역에는 풍부한 자포니카 벼(Oryza satiua ssp. japonica) 재배자원이 있다. 품종을 대면적으로 보급, 응용함에 따라, 육종 재료의 유전 기초가 날마다 좁아지고 유사성이 향상되어 자포니카 벼의 육종에 큰 어려움을 조성한다. 본 연구에서는 벼(Oryza satiua L.) 의 12개 염색체에 분포한 24쌍의 단순 반복 서열(simple sequence repeat, SSR)의 프라이머를 이용하여 타이후호 지역의 42개 자포니카 벼 품종의 유전 다양성을 분석하였다. 연구 결과, 42개의 자포니카 벼 재료에서 23쌍의 SSR가 다형성을 나타냈다. 23쌍의 프라이머에서 총 105개 대립유전자를 검출할 수 있었다. 매쌍의 SSR 프라이머에서 2~8개의 대립유전자를 검출하였으며, 평균치는 4.57개였다. 유효 대립유전자는 총 56.43개 있었으며, 각 부위의 평균치는 2.45개였다. 각 다형성 부위의 다형성 정보 함량(polymorphism information content, PIC)의 변화 폭은 0.0830~0.8079, 평균 0.4966였다. 각 자포니카 벼 재료의 다형성 부위 수의 변화 폭은 6~19, 대립유전자 총 수의 변화 폭은 27~55였다. 42개 자포니카 벼 품종 간의 유전 유사성 계수의 변화 폭은 0.391~0.990, 평균 0.610였다. 유전 유사성 계수가 0.50~0.80인 재료가 전체의 74.45%를 차지하였으며, 실험재료의 유사성은 높았다. UPGMA(unweighed pair group method with arithmetic mean) 클러스터링 결과, 유전 유사성 계수는 0.50였다. 42개 자포니카 벼 재료를 2개 집단으로 분류할 수 있었다. 즉 19개 일반 자포니카 벼를 포함하고 있는 집단과 23개 교잡 자포니카 벼를 포함하고 있는 집단이었다. 연구 결과는 타이후호 지역의 자포니카 벼 품종이 전반적으로 유전 배경 유사성이 높고 유전 다양성이 풍부하지 않아서, 육종작업 시 새로운 유전자원의 도입과 이용을 한층 더 강화하여 벼 육종 재료를 혁신할 필요가 있다는 것을 설명한다. 본 연구 결과는 새로운 품종의 선발육종을 위하여 기술 지원과 이론적 근거를 제공하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75845427
첨부파일

추가정보

과학기술표준분류, ICT 기술분류,DDC 분류,주제어 (키워드) 순으로 구성된 추가정보표입니다
과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Japonica rice,Simple sequence repeat markers,Genetic diversity,자포니카 벼,단순 반복 서열 마커,유전 다양성