초록 |
클로렐라-피레노이도사(Chlorella pyrenoidosa)의 탄산무수화 효소(carbonic anhydrase) 아형(α-CA、β-CA、γ-CA)의 유전자를 선별한 다음 암호화 단백질의 물리화학적 특성, 막관통 도메인(transmembrane domain), 신호 펩타이드, 단백질의 이차 및 삼차(secondary and tertiary) 구조를 분석 및 예측하였다. 연구 결과, 클로렐라-피레노이도사 α-CA, β-CA, γ-CA 단백질의 분자량은 각각 28.9kDa, 34.9kDa, 24.8kDa였고 차례로 산성, 약친수성(slightly hydrophilic), 지용성(fat-soluble) 단백질이었다. α-CA에서 강한 막관통 도메인과 신호 펩타이드 영역이 검출된 것으로 보아 세포외 CA인 것으로 추측된다. β-CA와 γ-CA에 신뢰성 있는 막관통 도메인과 신호 펩타이드 영역은 없었다. β-CA는 세포질 또는 엽록소 기질(stroma)에 존재하고 γ-CA는 미토콘드리아 기질에 존재하는 것으로 추측된다. CA 단백질의 이차구조(secondary structure) 예측 결과, α-CA에서 불규칙적 코일(random coil)의 백분율은 가장 높았고(64.66%) β-CA에서 α 나선과 불규칙적 코일이 차지하는 백분율은 각각 44.76%와 44.13%였고 γ-CA에서 α 나선과 불규칙적 코일의 함량은 각각 39.48%와 40.34%였다. 삼차구조(tertiary structure) 예측 분석 결과, α-CA 접힘은 풀린 상태였고 β-CA와 γ-CA의 접힘 수준은 긴밀하였으며 γ-CA는 반복 접힘 구조(repeated folding-structure)를 가지고 있었다. |