초록 |
본 논문에서는 PCR과 RT-PCR 방법을 결합하여 Fusarium oxysporum f. sp. cubense(FOC) 4호 생리 품종으로부터 FoGAS1 유전자의 DNA 및 cDNA 서열을 클론하였다. 그리고 생물정보학 방법을 이용하여 해당 유전자로 코딩된 아미노산 서열을 분석하여 해당 코딩 단백질의 구조와 기능을 예측하였다. 연구 결과, FoGAS1 유전자의 전체 길이는 1,672 bp이었다. 그중에 개방형 해독 틀(open reading frame)의 전체 길이는 1,623 bp이었고, 540개 아미노산 잔기(residue)를 함유한 단백질을 코딩하였다. 해당 단백질의 분자량은 58,398.1, 등전점 pI(isoclcctric point)는 4.83이었고 성질이 안정한 친수성 단백질(hydrophilic proteins)에 속하였다. FoGAS1 단백질은 막관통 단백질이었으며, 22개의 세린 인산화(serine phosphorylation) 위치, 2개의 트레오닌(threonine) 인산화 위치, 8개의 타이로신(tyrosine) 인산화 위치를 함유하였다. 해당 단백질은 C-말단에 하나의 신호 펩타이드(signal peptide) 구조가 있고 분비 단백질이었다. 계통수(phylogenetic tree) 분석을 진행한 결과, 해당 단백질은 종(species)이 서로 다른 푸사리움 속(Fusarium) 가운데 보존성이 높았다. |