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논문 기본정보

Large scale screening of genetic interaction with sgf73+ in fission yeast

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 遺傳 = Hereditas
ISSN 0253-9772,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) GUO, Yu-chen,LEI, Bing-kun,DENG, Xiao-long,YU, Yao,LV, Hong
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 유전자 상호작용(Genetic interaction, GI)은 생물체 내에서 각 유전자의 기능적 관련성을 직접 제시하기 때문에 유전자의 잠재적인 기능을 연구하는데 실마리를 제공한다. 유전자 선별은 유전자 상호작용을 연구하는데 중요한 방법이다. 본 논문에서는 SAGA(Spt-Ada-Gcn5 acetyltransferase) 복합체 탈유비퀴틴화 모듈(complex deubiquitination module)의 서브유닛(subunit) 유전자 sgf73 + 을 조회 유전자로 삼고 분열 효모(Schizosaccharomyces pombe) 중에서 대규모 유전자 선별을 진행했다. 연구 결과, 164개의 유전자는 sgf73 + 과 음성적 유전자 상호작용, 42개의 유전자는 양성적 유전자 상호작용을 지니고 있었다. GO(Gene ontology) 분석 결과, 이러한 유전자는 염색질 변형(Chromatin modification), DNA 손상과 회복, 스트레스 응답 및 RNA 전사 등 생물학적 과정에서 농축됐다. 히스톤 변형(histone modification) 검출 실험을 통하여 sgf73 + 의 결함이 히스톤 H3K9, H4K16 위치의 아세틸화(acetylation) 수준을 낮추고 H3K4 위치의 메틸화(methylation) 변형 수준을 향상시키는 것으로 처음 발견했다. 이 외에 시리즈 희석 실험 결과, sgf73△ 균주는 DNA 손상 시약인 HU와 CPT에 대한 민감성을 높였으며 Sgf73 + 은 고산소 스트레스(hyperoxia stress) 응답에 참여했다. 해당 결과, sgf73 + 은 염색질 변형, DNA 손상과 회복 및 고산소 스트레스 응답 등 생물학적 과정에 참여하는 것으로 나타났다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75837973
첨부파일

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) genetic interaction,fission yeast,sgf73+,histone modification,DNA damage repair,response to stress,유전자 상호작용,분열 효모,sgf73+,히스톤 변형,DNA 손상과 회복,스트레스 응답