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논문 기본정보

Bioinformatics Analysis and Function Prediction of AtTPS1 Gene in Arabidopsis thaliana

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 生物技術 = Biotechnology
ISSN 1004-311x,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) LU, Yu-jian,ZHANG, Wei,ZHANG, Han-jie,HAN, Wen-yu,SHEN, Zhi-qiang
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 목적: At TPS1유전자 및 그 암호화 산물의 구조, 발현 위치 확정, 분자 진화, 단백질 상호 작용에 대한 예측 및 분석을 진행하고자 한다. 방법: 온라인 네트워크 생물정보학 관련 데이터베이스 및 분석용 소프트웨어를 이용하여, 표적 단백질의 상동성(homology), 보존 영역(Conserved domain), 소수성(hydrophobicity), 막관통영역(transmembrane domain)에 대해 분석한다; 또한 유전자의 발현 상황, 단백질의 아세포 위치 확정, 단백질 사이의 상호 작용에 대해 예측한다. 결과: At TPS1는 비교적 강한 친수성(hydrophilicity)을 드러내었고, 폴리펩티드사슬(polypeptide chain)의 내부에는 막관통 구조(transmembrane structure)와 보존 영역이 존재할 가능성이 있다. 애기장대(Arabidopsis thaliana)의 서로 다른 조직과 기관에서 모두 At TPS1유전자 발현을 검측할 수 있는데, 특히 경정 분열조직(shoot apical meristem), 종자, 꽃에서 발현이 강열하였다. At TPS1은 엽록체에서 가장 널리 분포되었고, 그 다음은 미토콘드리아(mitochondria)와 세포핵이다. 최소한 4가지 유형의 단백질이 At TPS1와 비교적 강열한 상호 작용이 존재하였다. 결론: 생물정보학 분석 결과, At TPS1의 기능이 복잡하였는 바, 세포분열, 배아, 꽃의 발육, 종자발아(Seeds Germination), 광합성작용, 물질대사(material metabolism) 등 과정에서 중요한 역할을 담당하고 있을 가능성이 아주 크다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75838720
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Bioinformatics,Arabidopsis thaliana,AtTPS1 gene,Trehalose,Stress,생물정보학,애기장대,At,TPS1유전자,트레할로오스,스트레스