| 저자(한글) |
MENG, Meng,TANG, Wei,LIU, Jia,HUANG, Sheng-xiong,YU, Jin-de,LIU, Fang-fang,LIN, Lin,ZHANG, Xia,LIU, Yong-sheng |
| 초록 |
중국 키위(Actinidia chinese)의 EST-SSR 마커를 개발하고 28개 품종 키위 사이의 유전 다양성과 유전적 관계를 이해하고자, 중국 키위 'Hongyang' 전사체 서열에 대해 분석하였으며 분석 결과에 근거하여 SSR 프라이머를 설계하였다. 다음, CTAB법으로 28개 품종 키위의 DNA를 추출하여 SSR-PCR의 증폭 템플릿으로 하였으며 증폭 결과에 근거하여 클러스터 분석을 진행하였다. 연구 결과, 총 21,848개의 SSR을 포함한 서열을 얻었으며, 그 가운데 반복 모티브(motifs)가 모노-, 디-, 트리-, 테트라-, 펜타-, 헥사 뉴클레오티드인 서열은 각각 1,642, 15,965, 3,141, 248, 368과 484개였다. 이 가운데 임의로 46개의 서열을 선택하여 SSR 프라이머를 설계하였다. 초보적인 PCR 증폭에 근거하여, 밴드가 비교적 적고 밝은 32쌍의 프라이머를 선별하여 28개 품종 키위의 DNA 샘플에 대해 각각 증폭하였으며 프라이머에 대응하는 SSR 서열 위치를 결정하였다. 결과적으로 32쌍의 프라이머에 대응하는 서열 중 19개 서열의 정확한 유전자 ID, 염색체 번호, 염색체의 구체적 위치 정보를 얻을 수 있다. 이러한 프라이머 가운데 26쌍은 다형성을 갖고 있고 총 120개 대립유전자로 통계수치화 하였으며, 한 쌍의 프라이머는 1-11개(평균 3.75개)의 대립유전자를 얻을 수 있었다. 28개 키위 품종 사이의 유전적 유사 계수는 0.53-0.97 사이에 있고, 유전적 유사 계수가 0.72인 수준에서 5개 큰 유형으로 나눌 수 있으며 분류 결과는 기존 형태학의 분류와 기본적으로 일치하였다. 본 연구에서 보여준 각 샘플 사이의 유전적 관계는 미래 중국 키위 유전자원의 개량에 근거를 제공할 수 있다. |
