웹기반 전복류 (Haliotis) SNP 데이터베이스 구축
기관명 | NDSL |
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저널명 | 한국패류학회지 = The Korean journal of malacology |
ISSN | 1225-3480, |
ISBN |
저자(한글) | 정지은,이재봉,강세원,백문기,한연수,최태진,강정하,이용석,인제대학교 의과대학 기생충학교실,인제대학교 의과대학 기생충학교실,인제대학교 의과대학 기생충학교실,인제대학교 의과대학 기생충학교실,전남대학교 농업생명과학대학 식물생명공학부,부경대학교 미생물학과,국립수산과학연구원 생명공학과,인제대학교 의과대학 기생충학교실 |
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저자(영문) | |
소속기관 | |
소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2010-01-01 |
초록 | - 본 웹 데이터베이스 서버의 구축을 통해 Haliotis 속간의 염기서열과 일치하는 서열을 자체 BLAST 를 통해 매우 빠른 속도로 추출 할 수 있었다. - Repeat elements, E. coli, vector 등의 서열들과 동시에 BLAST를 시행할 수 있어 cDNA 또는 genomic DNA 라이브러리를 구축할 때 라이브러리의 오염, 삽입체의 길이 등의 상태를 쉽게 확인 할 수 있었다. - Clustering Res. 인터페이스를 통해 SNPs 발굴이 용이하게 되었으며 자체 구축된 primer3 를 통해 실험용 시발체를 제작할 수 있게 되었다 (Evans et al. 2001). - 이러한 SNP 데이터베이스 구축은 SNP 발굴 작업을 극대화 시킬 수 있어 차후 수행될 Haliotis 관련 분자육종 관련연구에 많은 도움이 될 것으로 기대된다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=JAKO201018860403883 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | Haliotis,SNP database,Web-interface |