| 초록 |
【목적】Alcanivorax dieselolei B-5은 중요한 석유에서 분해한 균(oil-degrading bacterium)이다. 할로겐 화합물(halogenated compound) 분해 범위와 분해 메커니즘을 연구한다. 【방법】서로 다른 할로겐 화합물을 유일한 탄소원으로, 해당 화합물 내 균주 B-5의 생장 상태를 관찰하였다. 다중 서열 비교, 계통발생 분석과 3차원 구조에 대한 상동성 모델링(homologous modeling)을 통하여 해당 균주의 유전체 내 하나의 추정상 할로알케인 디할로게나아제(Haloalkane dehalogenase, HLD) DadA를 분석하였다. 대장균(Escherichia coli)의 이형 발현( heterologous expression )을 이용하여 DadA를 정제하고 46개 할로겐 기질에 대한 효소 활성을 측정하였다. 【결과】균주 B-5는 C 3 -C 18 사슬 길이의 다중 할로겐 화합물을 유일한 탄소원으로 생장과정에 이용하였다. 계통 진화수에서 DadA는 기타 HLD-II의 아과(subfamily) 구성원 보다 독립적이었으나, 전형적인 HLD-II 아과의 촉매 5중체 잔기(catalytic p entaplet residue )를 갖고 있었다. DadA는 확실히 탈할로겐(dehalogenation) 활성을 갖고 있었으나, 해당 효소의 특이성은 높았으며, 기질의 범위는 기타 이미 감정된 HLDs보다 뚜렷하게 작았다. 오직 1,2,3-트리브로모프로판(1,2,3-tribromopropane), 1,2-디브로모-3-클로로프로판(1,2-dibromo-3-chloropropane), 2,3-디클로로프롭-1-엔(2,3-dichloroprop-1-ene)에 대해서만 디할로게나아제 활성을 나타냈다. 【결론】DadA은 많은 B-5 균주가 탄소원으로 이용할 수 있는 할로겐 기질에 대하여 디할로게나아제 활성을 나타내지 않았다. 그러므로 B-5균 내에 할로알케인의 분해에 참여하는 기타 디할로게나아제가 있는 것으로 추정된다. 균주 B-5 및 그 할로알케인 디할로게나아제 DadA는 할로알케인 오염물질의 생분해 측면에 대한 응용 잠재력을 갖고 있었다. |
