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논문 기본정보
Genome-wide analysis of HSP70 superfamily in Gossypium raimondii and the expression of orthologs in Gossypium hirsutum
논문 개요
| 기관명 | NDSL |
|---|---|
| 저널명 | 遺傳 = Hereditas |
| ISSN | 0253-9772, |
| ISBN |
논문저자 및 소속기관 정보
| 저자(한글) | ZHANG, Yu-ting,WANG, Min-hua,CHEN, Jia-dong,RONG, Jun-kang,DING, Ming-quan |
|---|---|
| 저자(영문) | |
| 소속기관 | |
| 소속기관(영문) | |
| 출판인 | |
| 간행물 번호 | |
| 발행연도 | 2014-01-01 |
| 초록 | 열 충격 단백질 70 족(Hsp70)은 식물 중에 고도 보존적인 분자적 샤프론(molecular chaperone)이고 세포 중에 단백질의 올바른 접힘(folding)에 협조한다. 본 논문에서는 은닉 마르코프 모델(Hidden Markov Model, HMM)을 이용하여 Gossypium raimondii L. 전체 유전체 범위 내에 HSP70 유전자군의 진화 분석을 진행하여 30개 HSP70 족의 구성원을 얻었다. 생물정보학을 이용하여 Gossypium raimondii L. HSP70 유전자의 구조, 염색체 분포, 유전자가 배로 증가한 패턴 및 계통 발생을 분석한 결과, HSP70 유전자군은 세포 내 위치 예측(subcellular localization) 결과에 의거하여 서로 다른 유전자 아군(subfamily)으로 나눌 수 있고 각 아군 중의 HSP70 유전자는 상대 보존적인 유전자 구조를 지니고 있다. 염색체 단편 반복 및 직렬 반복(tandem duplication)은 Gossypium raimondii L. HSP70 유전자군의 주요 증폭 방식이다. 서로 다른 종(species)의 HSP70 유전자군에 대한 계통 발생 분석을 진행한 결과, HSP70 아군의 분화는 단세포 식물 형성 전에 발생하였으며 세포질형(cytoplasmic) HSP70 구성원이 많이 증폭되었다. 육지면 면섬유의 다양한 발달 시기의 심층 서열 분석(deep sequencing) 발현 프로파일(expression profile)을 비교하여 HSP70 유전자가 면섬유의 생장과 발육에 참여할 수 있는 것을 발견하였다. 본 연구의 결과는 목화 속 식물의 HSP70 유전자군 기능을 이해하는데 도움이 되어 면섬유 발달 과정 중의 분자 조절 메커니즘을 한층 더 연구하는데 기초를 마련하였다. |
| 원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75840910 |
| 첨부파일 |
추가정보
| 과학기술표준분류 | |
|---|---|
| ICT 기술분류 | |
| DDC 분류 | |
| 주제어 (키워드) | cotton fiber,HSP70 family,deep sequencing,gene structure,phylogenic analysis,면섬유,HSP70 족,심층 서열분석,유전자 구조,계통발생 분석 |