| 초록 |
SSRs(Simple sequence repeats)는 동물과 식물 유전체에 널리 존재하는 DNA 짧은 연쇄 반복 서열이고 중요한 유전체 분자 마커이다. 서로 다른 유전체 상동 SSR의 차이에 대한 비교는 유사 종(species) 사이의 진화 과정을 이해하는데 도움이 된다. 본 논문에서는 Gossypium raimondii 유전체(D5), 아시아면(Gossypium arboreum) 유전체(A2)의 전유전체 서열 및 육지면(AD1)의 제한효소 절단 유전체 서열 측정 데이터를 이용하여, 전유전체 SSR 스캐닝을 진행하고 A 그룹과 D 그룹의 SSR 분포 상황을 비교하였다. 또한, 3개 유전체 사이의 상동 SSR을 식별하여 그것들의 상동 SSR 반복 서열의 차이를 비교하였다. 연구 결과, A 그룹과 D 그룹 상동 SSR의 분포 규칙은 매우 비슷하였지만, A 그룹과 AD 그룹의 상동 SSR 보존성은 D 그룹과 AD 그룹의 상동 SSR 보존성보다 강하였다. AD 그룹 상동 SSR에 비하여 A 그룹에서 반복 서열 길이가 증가하는 SSR 수량은 길이가 짧아지는 SSR 수량의 5배 정도이었으며, D 그룹에서는 이 비율이 3배 정도였다. 그러므로 사배체 AD 그룹은 A, D 그룹과의 평행 진화 과정에서 유전체 융합 때문에 SSR의 반복 서열 길이 변화 속도는 U-배체 A, D 그룹과 차이가 생기게 하였으며, 동시에 이러한 차이는 AD 그룹의 SSR 반복 서열 길이에 진화 과정에서 이배체보다 짧아지는 변화 추세를 초래하였다. 본 논문은 처음으로 3개 목화 유전체의 상동 SSR을 체계적으로 비교하여 상동 SSR이 목화 속 사배체 유전체와 이배체 유전체에서의 뚜렷한 차이를 발견하였다. 이 결과는 목화 속 유전체의 진화 규칙을 밝히는데 기초를 마련하였다. |
