저자(한글) |
LIU, Xin,ZHANG, Jie,ZHAO, Chun-hui,LI, Tie-song,WANG, Ji-hong,LI, Qing-wei |
초록 |
MicroRNAs(miRNAs)는 여러 가지 생물 대사 과정에 참여하는 유전자에 대하여 전사 및 전사 후 수준에서 음성적으로 조절한다. 최근 몇 년간, 심도 시퀀싱 및 마이크로어레이 기술의 응용과 더불어, miRNA에 관련된 발견과 기능 분석은 식물과 동물에서 널리 연구되었다. 본 논문에서는 차세대 시퀀싱 기술을 사용하여 칠성장어(Lampetra japonica) 백혈구의 작은 RNA에 대한 고속통과 시퀀싱을 진행하였으며, 이로써 5,207,787개의 작은 RNA 서열을 얻었고 그중 4,739,346개의 서열은 10,989가지의 miRNA 변이체로 조립될 수 있다. 서열 유사성 분석 결과, 10,989개 변이체 서열은 306개의 분명한 보존적인 miRNA 패밀리 구성원의 서열과 맞았으며, 그중 6개의 보존적인 miRNA 패밀리 구성원은 발현 풍부도가 매우 높았다. 이는 miRNA가 종 사이에 보존성이 있는 것으로 나타났다. 70개의 주석되지 않는 서열은 새로운 miRNA로 예측하였다. miRNA 마이크로어레이 기술을 통하여 면역 처리된 칠성장어 백혈구에서 34개 새로운 miRNA의 발현을 감정하고 검증하였다. 그중, 16개 miRNA 전구체의 최저 접힘 자유 에너지(folding free energy) 계수가 0.85보다 컸다. 이는 칠성장어에 특이성 miRNA가 존재하는 것으로 나타났다. 이러한 종 특이성 miRNA의 존재는 칠성장어의 백혈구 생장, 발육 및 질환에 대한 반응에서 중요한 조절 역할을 할 가능성이 있다. |