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논문 기본정보

The identification and verification of species-specific microRNAs and their precursors in Lampetra japonica

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 遺傳 = Hereditas
ISSN 0253-9772,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) LIU, Xin,ZHANG, Jie,ZHAO, Chun-hui,LI, Tie-song,WANG, Ji-hong,LI, Qing-wei
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 MicroRNAs(miRNAs)는 여러 가지 생물 대사 과정에 참여하는 유전자에 대하여 전사 및 전사 후 수준에서 음성적으로 조절한다. 최근 몇 년간, 심도 시퀀싱 및 마이크로어레이 기술의 응용과 더불어, miRNA에 관련된 발견과 기능 분석은 식물과 동물에서 널리 연구되었다. 본 논문에서는 차세대 시퀀싱 기술을 사용하여 칠성장어(Lampetra japonica) 백혈구의 작은 RNA에 대한 고속통과 시퀀싱을 진행하였으며, 이로써 5,207,787개의 작은 RNA 서열을 얻었고 그중 4,739,346개의 서열은 10,989가지의 miRNA 변이체로 조립될 수 있다. 서열 유사성 분석 결과, 10,989개 변이체 서열은 306개의 분명한 보존적인 miRNA 패밀리 구성원의 서열과 맞았으며, 그중 6개의 보존적인 miRNA 패밀리 구성원은 발현 풍부도가 매우 높았다. 이는 miRNA가 종 사이에 보존성이 있는 것으로 나타났다. 70개의 주석되지 않는 서열은 새로운 miRNA로 예측하였다. miRNA 마이크로어레이 기술을 통하여 면역 처리된 칠성장어 백혈구에서 34개 새로운 miRNA의 발현을 감정하고 검증하였다. 그중, 16개 miRNA 전구체의 최저 접힘 자유 에너지(folding free energy) 계수가 0.85보다 컸다. 이는 칠성장어에 특이성 miRNA가 존재하는 것으로 나타났다. 이러한 종 특이성 miRNA의 존재는 칠성장어의 백혈구 생장, 발육 및 질환에 대한 반응에서 중요한 조절 역할을 할 가능성이 있다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART74117923
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Lampetra japonica,species-specific miRNA,high-throughput sequencing,microarray assay,칠성장어,종 특이성 miRNA,고속통과 시퀀싱,유전자 마이크로어레이