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논문 기본정보

Cloning and Expression Analysis of the Transcription Factor SmMYB7 from Salvia miltiorrhiza Bunge

논문 개요

기관명, 저널명, ISSN, ISBN 으로 구성된 논문 개요 표입니다.
기관명 NDSL
저널명 基因組學與應用生物學 = Genomics and applied biology
ISSN 1674-568x,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

저자, 소속기관, 출판인, 간행물 번호, 발행연도, 초록, 원문UR, 첨부파일 순으로 구성된 논문저자 및 소속기관 정보표입니다
저자(한글) ZHU, Xiao-ya,CUI, Cui,ZHOU, Hong-jun,WU, Yu-cui,WANG, Zhe-zhi
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2015-01-01
초록 본 논문에서는 단삼(Salvia miltiorrhiza Bunge) 전사체 데이터베이스(SRX021907)를 분석하여 유전자 R2R3-MYB를 획득하였으며, blast 비교를 통하여 이 유전자가 단삼 SmMYB7(KF059361.1)인 것을 발견하였다. 또한, 각각 gDNA와 cDNA 수준에서 해당 유전자의 전체 길이를 클론하였으며 서열 분석을 진행한 결과, 이 유전자는 발표된 서열과 일치하였다. 그리고 이 유전자는 인트론 서열이 없고 길이가 954 bp인 개방형 해독틀(ORF)을 포함하며 317개의 아미노산 잔기를 부호화하였다. 다중 서열 비교 및 계통수 분석에 따른 결과, SmMYB7 단백질과 애기장대 AtMYB73은 R2R3-MYB의 22번째 서브패밀리(subfamily)에 속하였다. 기존의 단삼 유전자 정보와 BD walking을 결합하여 1,974 bp의 프로모터 서열을 얻었다. 분석 결과를 통하여, 여러 가지 시스 작용 요소(cis-acting element)가 해당 유전자의 프로모터 영역에 존재하는 것으로 나타났다. 실시간 형광 정량 PCR 분석 결과, 해당 유전자는 조성형으로 발현하고 단삼의 뿌리, 줄기, 잎과 꽃에서 발현하였다. 꽃의 발달과 더불어 해당 유전자의 발현량이 점차 많아졌다. 이 외에, SmMYB7이 염분 스트레스, 살리실산(salicylic), 자스모네이트(jasmonate) 및 아브시스산(abscisic acid) 처리에서 상향 발현하였다. 이로부터 해당 유전자가 식물 방어와 꽃 발달의 조절에 참여하는 것을 추측하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75847453
첨부파일

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) Salvia miltiorrhiza Bunge,SmMYB7,Bioinformatics analysis,Expression analysis,단삼,SmMYB7,생물정보학적 분석,발현 패턴 분석