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논문 기본정보

Fine mapping of the mutant genevarnished eye in the silkworm

논문 개요

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기관명 NDSL
저널명 遺傳 = Hereditas
ISSN 0253-9772,
ISBN

논문저자 및 소속기관 정보

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저자(한글) LIU, Chun,LI, Qiong-yan,XUN, Li-jie,HU, Wen-bo,LV, Jin-feng,LIU, Ru-feng,XIA, Qing-you
저자(영문)
소속기관
소속기관(영문)
출판인
간행물 번호
발행연도 2014-01-01
초록 집누에(Bombyx mori) varnished eye(ve) 돌연변이체는 집누에 돌연변이 품종에서 소수의 집누에 겹눈(compound eye) 형태 이상에 관련된 자연적인 음성 돌연변이 품종의 하나로서, 성충 겹눈이 작고 표면에 광택이 나며 혹모양의 돌기가 있으며 낱눈(ommatidia) 수량이 적고 불규칙하다. 전형적인 유전학 연쇄 지도를 사용하여 ve 유전자를 제6 연쇄군 32.2 자리에 위치 결정하였지만, 지금까지 해당 돌연변이 형질의 형성 메커니즘에 대하여는 아직 명확하지 않다. 본 논문에서는 돌연변이 품종 ve 및 대조 품종 Dz를 교배모본(parent)으로 하고, 교잡 생성되는 F 1 세대 우성 개체 및 반복친(recurrent parent) ve 자성 개체가 역교배 생산되는 BC 1 세대를 재료로 하여 ve 유전자의 정밀 위치 결정을 진행하였다. ve 저밀도 연쇄 지도를 통한 분석 결과, ve 유전자는 SNP3~SNP6 사이에 위치 결정되었으며 물리적 지도 거리는 약 1.2 Mb이었다. 1,563개 BC 1 세대 개체를 사용하여 ve의 고밀도 연쇄 지도를 구축하여, 최종적으로 ve 유전자를 SNP5~SNP61 사이에 위치 결정시켰으며 물리적 지도 거리는 약 221.8 kb이었다. 집누에 유전자 데이터베이스를 통하여 ve의 최종 위치 결정 구역에서 예측 유전자 검색을 진행하여 6개 예측 유전자를 발견하였다. 이 6개 예측 유전자에 대하여 생물정보학 분석 및 서열 측정을 진행한 결과, 이런 후보 유전자는 집누에 겹눈의 형성에 참여할 수 있지만, 코딩 구역에서 ve의 특이적인 돌연변이 부위를 발견하지 못하였다. 또한, 이런 후보 유전자에 대한 발현 분석 결과, 번호가 BGIBMGA013642인 후보 유전자가 ve 겹눈 형성 과정에서의 발현량은 정상적인 Dz 대조군보다 뚜렷하게 낮은 것으로 나타났다. 이로써 해당 유전자는 최적 후보 유전자인 것으로 추측하였다.
원문URL http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART75843820
첨부파일

추가정보

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과학기술표준분류
ICT 기술분류
DDC 분류
주제어 (키워드) silkworm(Bombyx mori),varnished eye,SNP marker,fine mapping,candidate genes,집누에,varnished eye,SNP 마커,정밀 위치 결정,후보 유전자