초록 |
헤이룽장성(Heilongjiang Province) 청산임목종자원의 성숙 들메나무(Fraxinus mandshurica Rupr.) 200그루를 선택하여 실험재료로 하였으며, NCBI 중의 5,423개 물푸레나무속(Fraxinus) EST 서열과 해당 실험으로부터 측정하여 얻은 들메나무 전사체의 179,502개 서열에서 SSR 사이트를 검색하고 또 프라이머를 설계하였다. PCR 증폭을 통하여 유효 증폭과 차이가 있는 조각의 프라이머를 선별하였으며, 들메나무 성별 감정에 이용하였다. 분석결과, (1) 물푸레나무속 EST와 들메나무 전사체 중의 5,423개와 179,502개 서열에서 각각 9,488개와 3,557개 SSR 사이트를 찾았으며, SSR 발생 빈도는 각각 174.96%와 1.98%이었고, SSR의 유형은 모두 디뉴클레오티드를 주요로 하였다. (2) 232쌍 프라이머 중 208쌍 프라이머는 효과적으로 증폭되었으며, 74쌍 프라이머는 자웅 DNA에서 차이가 있었고, 27쌍 증폭 조각은 예정한 크기의 조각에 부합되었다. (3) 3차례 선별을 통하여, 19호와 56호 프라이머를 선택하여 200그루 들메나무에 이용하였으며, 자웅 차별률은 각각 64.5%와 89.5%이었다. 결과적으로 EST-SSR 분자 마커를 이용하여 들메나무 성별을 감정하는 것은 효과적이고 실행 가능한 방법이라는 것을 알 수 있다. |