| 저자(한글) |
PAN, Ting,ZHANG, Yan,ZHANG, Hui,GAO, Tian-xiang,XIAO, Yong-shuang,JIANG, Yun-rong |
| 초록 |
Roche 454 GS FLX 플랫폼 시퀀싱 기술을 이용하여 문차가자미(leuronectes yokohamae)의 미소부수체 프라이머를 선별하고, 클러스터링 분석기법을 이용하여 5,641개 미소부수체 부위를 비교, 분석함으로써 247개 다형성 부위를 얻었다. 그 중 완벽한 부위는 52.22%, 완벽하지 않은 부위는 20.24%, 복합형은 27.54%를 차지하였다. (AC)n, (AG)n 등 두 염기 반복 유형의 비율은 44%였으며, 반복 횟수가 10회 이상인 부위는 총 수의 87.5%를 차지하였다. 11개 부위의 미소부수체 프라이머를 무작위로 선택한 후, 5개 야생 개체를 대상으로, 형광 마커와 미세관 전기영동을 이용하여 다양성을 평가하였다. 4개 부위가 Hardy-Weinberg 평형을 벗어났으며, 다양한 부위에서 얻은 대립유전자의 범위는 3-8, 평균 대립유전자 수는 5.0이었다. 관찰된 이형 접합성(observed heterozygosity, Ho)의 평균값과 기대된 이형 접합성(expected heterozygosity, He)의 평균값 및 다형성 정보 함량(polymorphic information content, PIC)의 평균값은 각각 0.588, 0.788, 0.670였다. 연구 결과, 454 GS FLX은 미소부수체를 직관적, 효과적으로 개발할 수 있는 기법을 제공하였다. |
