Sequence Divergence of Arabidopsis Argonaute 1/2/4/5 and Their Coordinated Expression with Specific miRNAs
기관명 | NDSL |
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저널명 | 中國生物化學與分子生物學報 = Chinese journal of biochemistry and molecular biology |
ISSN | 1007-7626, |
ISBN |
저자(한글) | ZHAO, Wen-wen,HAN, Ying-ying,LIU, Bao-lin,WANG, Zhi-cui |
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저자(영문) | |
소속기관 | |
소속기관(영문) | |
출판인 | |
간행물 번호 | |
발행연도 | 2015-01-01 |
초록 | Argonaute(Ago)는 RNA 유도에 의한 유전자 침묵 복합체(RISC) 중 하나의 중요한 구성 부분이며 RNA 침묵 경로의 소분자 RNA 결합 과정에서 중요한 역할을 한다. 본 논문은 12개 생물종의 85개 Ago/Ago-like 유전자 서열에 대한 계통 발육 분석(phylogenetic analysis)을 수행한다. 실험 결과, 식물의 Ago는 3개 큰 분류로 나뉘어졌으며, 그의 유전자는 생물종의 분기 발생전에 이미 반복 과정을 발생했다. 3개 분류 사이에는 동의(synonymous)와 비동의 돌연변이가 자주 발생하는데, 이는 Ago 단백질 패밀리 기능의 높은 보존성을 설명한다. 형광정량 PCR 기법을 사용하여 애기장대의 서로 다른 발육 단계와 스트레스 조건에서 Ago1/2/4/5의 발현 상황을 분석하였다. 그 결과, 애기장대 유묘와 성숙 조직 내에서 Ago1이 뚜렷하게 발현되었다; 23℃(최적 온도)와 비교했을 때 16℃[부적절 온도(sub-optimal temperature] 조건에서 Ago1 발현량이 뚜렷하게 하향 조절되었으며 Ago5 발현량이 뚜렷하게 상향 조절되었다; 탈수 스트레스(dehydration) 조건에서 Ago5 발현량이 하향 조절되었고 Ago4 발현량이 상향 조절되었다. 이외에 5' 말단 염기(5' nucleotide type of miRNA) 유형이 서로 다름에 따라 188,954개 유묘의 miRNAs와 2,047,843개 성숙 조직의 miRNAs이 분류되었다. 실험 결과, 식물 가운데서 5' 말단이 U인 miRNAs의 함량이 가장 많았는데, 이는 가장 많은 발현량을 가진 Ago1과 협동 관계를 나타냈다; 16℃ 온도 조건에서 5' 말단이 C인 miRNAs와 Ago5의 발현이 협동적으로 상향 조절되었다. 이런 결과로부터 Ago 단백질과 그가 선호하는 miRNAs의 협동 발현을 알 수 있다. |
원문URL | http://click.ndsl.kr/servlet/OpenAPIDetailView?keyValue=03553784&target=NART&cn=NART72361003 |
첨부파일 |
과학기술표준분류 | |
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ICT 기술분류 | |
DDC 분류 | |
주제어 (키워드) | phylogenetic analysis,argonaute,5' nucleotide type of miRNA,sub-optimal temperature,dehydration,synergistic expression,계통 발육 분석,argonaute,miRNA 의 5' 말단 염기 유형,부적절한 온도,탈수 스트레스,협동 발현 |