| 초록 |
본 발명은 특정한 펩티드, 그리고 선별된 반응 모니터링 (SRM) 질량 분광분석법, 또는 복수 반응 모니터링 (MRM) 질량 분광분석법의 방법에 의해, 포르말린에서 고정된 생물학적 표본에서 직접적으로 ALK, Ros, Ron, Ret, TS, 및/또는 FGFR1 단백질을 정량하는데 특히 유리한 ALK, Ros, Ron, Ret, TS, 및/또는 FGFR1 단백질로부터 도출된 이들 펩티드의 이온화 특징을 제공한다. 이런 생물학적 표본은 화학적으로 보존되고 고정되고, 여기서 생물학적 표본은 포르말린-고정된 조직/세포, 포르말린-고정된/파라핀 포매된 (FFPE) 조직/세포, FFPE 조직 블록과 이들 블록으로부터 세포, 그리고 포르말린 고정되고 및 또는 파라핀 포매된 조직 배양 세포를 비롯하여, 포름알데히드 내포 작용제/고정제로 처리된 조직과 세포에서 선택된다. 단백질 표본은 Liquid Tissue™ 시약과 프로토콜을 이용하여 생물학적 표본으로부터 제조되고, 그리고 ALK, Ros, Ron, Ret, TS, 및/또는 FGFR1 단백질은 설명된 펩티드 중에서 최소한 하나 또는 그 이상을 단백질 표본에서 정량함으로써, SRM/MRM 질량 분광분석법의 방법에 의해 Liquid Tissue™ 표본에서 정량된다. 이들 펩티드는 그들이 변형된 또는 변형되지 않은 형태에서 존속하면 정량될 수 있다. ALK, Ros, Ron, Ret, TS, 및/또는 FGFR1 단편 펩티드의 변형된 형태의 실례는 펩티드 서열 내에서 티로신, 트레오닌, 세린, 및/또는 다른 아미노산 잔기의 인산화이다. |
