초록 |
생화학 반응에 최적화된 효소 변이체의 생성을 위하여 관심 부위에서 아미노산 치환을 예측하기 위한 인실리코(in silico) 방법은, 결합된 리간드에 근접한 효소의 상기 관심 부위 및 효소의 구조와 관련된 정보를 입력받는 단계, 상기 관심 부위에 있는 WT 아미노산의 기능성 원자 및 상기 리간드의 기능성 원자를 식별하는 단계, 상기 WT 아미노산의 기능성 원자 및 상기 리간드의 기능성 원자들의 특성을 확인하는 단계, 상기 WT 아미노산의 기능성 원자와 상기 리간드의 기능성 원자 사이의 상호 작용이 존재하는지 여부를 검출하는 단계, 상기 상호 작용의 검출 여부에 따라 대안적 아미노산들을 선택하는 단계, 상기 선택된 대안적 아미노산들 각각에 대하여 점수를 결정하는 단계, 상기 선택된 대안적 아미노산들에 대하여 상기 점수에 기초하여 순위를 설정하는 단계; 및 상기 효소의 최적화를 위해 상기 선택된 대안적 아미노산들 중에서 높은 순위의 대안적 아미노산들의 치환을 예측하는 단계를 포함한다. |