초록 |
본 발명은 다음 단계를 포함하는, 전사체 존재비를 추정하는 방법에 관계한다: a) 관심되는 유전자 좌위의 전사체의 잠재적 혼합체로부터 전사체 단편 염기서열결정 데이터를 획득하고, b) 상기 단편 염기서열결정 데이터를 관심되는 상기 좌위의 유전자 좌표에 배정하고, 따라서 단편 유전자 좌표 범위의 데이터 세트를 획득하고, 각 유전자 좌표에 대한 상기 범위는 합동되어 범위 포락선을 형성하고, c) 상기 혼합체의 전사체의 숫자를 세팅하고, d) 각 전사체 i에 대한 모형화된 유전자 범위의 확률 분포 함수를 미리 조정하고, i는 전사체에 대한 수치 식별자를 나타내고, 여기서 상기 확률 분포 함수는 상기 전사체 i의 가중 인자 α i 의 수학적 산물 및 최소한 2개의 확률 부함수 j의 합계로 구성되고, j는 확률 부함수에 대한 수치 식별자를 나타내고, 각 확률 부함수 j는 가중 인자 β i,j 에 의해 독립적으로 가중되고, e) 각 전사체에 대한 확률 분포 함수를 추가하여 합계 함수를 획득하고, f) 합계 함수를 범위 포락선에 적합시키고, 따라서 α i 와 β i,j 에 대한 값을 최적화하여 적합을 증가시키고, g) 미리 조정된 수렴 규준 실현될 때까지 단계 e)와 f)를 반복하고, 따라서 수렴 규준이 실현된 후에 최적화될 때 가중 인자 α i 에 의해 제공된 혼합체의 각 전사체의 추정된 전사체 존재비를 획득한다. |