| 초록 |
□ 연구개요 직결장암의 원발암 및 전이암 조직과 Liquid biopsy (ctDNA, exosome)를 이용한 암전이 특이 유전자 발굴 및 기능연구를 통한 치료 전략 개발 □ 연구 목표대비 연구결과 1차년도: 직결장암 환자 시료수집 및 원발암과 전이암 조직에서 NGS 기술을 이용한 전이 특이 유전자 변이 발굴 -<Discovery set> 후향적 직결장암 환자의 원발암과 전이암 조직 100쌍 (200건) 확보를 목표로 조직을 수집, 확보된 discovery set 조직의 ICP panel 분석 수행 -<Validation set> 전향적 직결장암 환자의 원발암과 전이암 조직, 혈액 검체를 매년 20쌍 (조직 40건, 혈액 검체 40건) 및 serial 혈액 검체의 확보를 목표로 조직 및 혈액 검체를 수집 (1~4차년도까지 동일) 2차년도 :직결장암 환자 시료 수집 및 원발암과 전이암 조직에서 NGS 기술을 이용한 전이 특이 유전자 변이 발굴 -1,2차년도 전향적으로 수집한 직결장암 환자의 원발암과 전이암 조직을 ICP panel 분석 -수집된 환자의 혈액 검체에서 ctDNA 및 exosomal RNA 분리, QC 기술 개선 -수집된 혈액검체 내 ctDNA를 ICP panel로 분석 3차년도: 직결장암 환자 시료수집 및 원발암과 전이암 조직에서 NGS 기술을 이용한 전이 특이 유전자 변이 발굴 -2,3차년도 전향적으로 수집한 직결장암 환자의 원발암과 전이암 조직, ctDNA의 ICP panel 분석 -수집된 혈액 검체 내 exosomal RNA의 RNA sequencing 분석 4차년도: 직결장암 환자 시료 수집 및 유전자 변이 serial 변화 분석, 발굴한 전이 특이 유전자의 기능 연구 -3,4차년도에 전향적으로 수집한 직결장암 환자의 원발암과 전이암 조직, ctDNA의 ICP panel분석 및 exosomal RNA의 RNA sequencing 분석 -Discovery set (1차년도) 조직 ICP panel 결과와 Validation set(1~4차년도)의 조직 및 ctDNA의 panel 분석 결과를 비교 검증 -ICP panel 분석에서 확인된 전이 특이 유전자 변이를 ddPCR로 검증 5차년도: 전이성 직결장암의 전이, 재발, 항암내성 바이오 마커의 기능 연구를 통한 치료전략 개발 -1~4차년도에 전향적으로 수집한 직결장암 환자의 전이암절제술 전/후 시점과 재발 시점 혈액 내 exosomal RNA을 이용한 RNA sequencing 분석 -최종 임상경과에 따른 유전자 변이 바이오마커들의 임상적 활용성 규명과 데이터 정리 □ 연구개발성과의 활용 계획 및 기대효과(연구개발결과의 중요성) - 전이성 직결장암의 원발암과 전이암 조직의 유전자 변이 비교 분석 및 전이암 특이적 유전자 변이 확인을 통해 전이 및 재발예측 바이오마커로의 발굴 → 정밀의학 도입에 기여 - 환자의 액체생검 분석 시 임상적 상황에 따른 분석법 가이드라인 제시하여 분자 진단 검사시 맞춤형 분자진단 및 불필요한 검사의 남용을 막아 경비 절약 및 환자의 삶의 질 개선 효과 - 조직과 액체생검 시료로부터 저빈도 유전자 변이 검출 기술의 최적화 및 분자진단 기술력 확보 - NGS 기술을 이용한 직결장암 환자의 전이 예측 바이오마커 및 임상적 연관성에 대한 결과를 SCI 저널에 발표함 및 특허를 등록함으로서 표준 치료법 확립에 기여 (특허에 대한 기술이전 준비중) - 패널분석, 데이터분석, 결과 및 임상 상담 전문 인력 양성 (출처 : 연구결과 요약문 2p) |
